Convertir RIS en BIBTEX

Un projet LaTeX ou BibLaTeX, une bibliothèque JabRef ou un collaborateur peut nécessiter des références dans un fichier .bib plutôt qu’au format RIS. La conversion préserve les métadonnées de citation réutilisables pour la modification, la recherche et l’insertion de citations.

Qu’est-ce que RIS ?

RIS est un format d’échange en texte brut balisé utilisé par les bases de données universitaires, les catalogues de bibliothèques et les gestionnaires de références. Chaque enregistrement contient des balises à deux caractères telles que TY pour le type de référence, AU pour l’auteur, TI pour le titre, JO pour la revue, PY pour l’année de publication et DO pour le DOI ; ER marque la fin d’un enregistrement.

Web of Science, Scopus, PubMed, ProQuest et de nombreux catalogues de bibliothèques peuvent exporter au format RIS. Zotero, EndNote, Mendeley et RefWorks peuvent également l’importer ou le créer. RIS est destiné à l’échange ; les exportateurs n’utilisent donc pas toujours des balises identiques et n’associent pas systématiquement les types de références de la même manière. Il n’existe pas d’équivalent standard à une clé de citation BibTeX.

Qu’est-ce que BibTeX ?

BibTeX stocke les références sous forme d’entrées telles que @article, @book et @inproceedings, avec des champs comprenant author, title, year, journal et doi. Chaque entrée possède une clé de citation, telle que Smith2024, utilisée par les commandes de citation LaTeX.

Un fichier .bib est du texte brut ; il peut donc être recherché, modifié, géré avec un système de contrôle de version et partagé avec un projet LaTeX. BibLaTeX prend en charge davantage de types d’entrées et de champs que le BibTeX traditionnel, mais le format requis dépend de la chaîne d’outils du document. Un fichier nommé .bib n’est pas nécessairement valide pour tous les flux de travail BibTeX ou BibLaTeX.

Convertir avec Zotero

Zotero convient à la plupart des conversions sur ordinateur et permet d’inspecter les enregistrements avant l’exportation.

1. Ouvrez Zotero et choisissez File → Import.
2. Sélectionnez l’option permettant d’importer un fichier, choisissez le fichier RIS et terminez l’importation.
3. Inspectez les auteurs, les titres, les dates, les types de références, les DOI, les URL et les enregistrements en double.
4. Sélectionnez les enregistrements, cliquez dessus avec le bouton droit, puis choisissez Export Items….
5. Choisissez BibTeX ou BibLaTeX, puis enregistrez le résultat sous le nom references.bib.

Zotero génère les clés de citation lors de l’exportation. Si un projet nécessite un modèle de clé défini ou des clés stables, utilisez l’extension Better BibTeX for Zotero et configurez son format de clé de citation avant l’exportation. Ne modifiez pas les clés après que des fichiers LaTeX les ont déjà référencées, à moins de mettre à jour les citations.

Convertir avec JabRef

JabRef est utile lorsque le fichier résultant sera géré comme une base de données BibTeX.

1. Ouvrez JabRef et choisissez File → Import into new library ou File → Import into current library.
2. Sélectionnez le fichier RIS et confirmez l’importateur RIS si vous y êtes invité.
3. Examinez les champs importés, lancez la détection des doublons et corrigez les types d’entrées ou les noms de champs.
4. Choisissez File → Save library et enregistrez la base de données sous le nom references.bib.

Convertir par lots avec bibutils

Le package open source bibutils convient aux conversions répétables ou scriptées. Son intermédiaire XML facilite l’inspection de la transformation :

ris2xml references.ris > references.xml
xml2bib references.xml > references.bib

Installez bibutils à l’aide du gestionnaire de paquets du système d’exploitation, puis ouvrez le fichier généré dans un éditeur de texte ou une application BibTeX et validez-le avant utilisation. Les options d’importation et d’exportation peuvent varier selon la version de bibutils.

Utiliser prudemment un convertisseur en ligne

Pour un fichier ponctuel non confidentiel, la démonstration de Citation.js dans le navigateur peut lire le format RIS et générer du BibTeX, à condition que la démonstration actuelle expose les deux formats. Des services généraux de conversion de fichiers tels que Zamzar ou Convertio peuvent également proposer une conversion de RIS vers BIB ; vérifiez que le format de sortie sélectionné est bien BibTeX plutôt qu’un format bibliographique au nom similaire.

Ne téléversez pas de références non publiées, de notes privées, d’exportations de bases de données sous licence ou de métadonnées personnelles vers un service en ligne. Le résultat téléchargé doit tout de même être validé manuellement, car les convertisseurs web peuvent omettre des champs, modifier les encodages ou générer des clés de citation inadaptées.

Vérifier le fichier converti

• Les types de références RIS ne correspondent pas un à un aux types BibTeX. Les communications de conférence, les rapports, les thèses, les jeux de données et les articles en ligne peuvent nécessiter un type d’entrée différent ou des champs spécifiques à BibLaTeX.
• Préservez les noms d’organisations avec des doubles accolades, par exemple author = {{World Health Organization}}, afin que BibTeX ne divise pas le nom en prénom et nom de famille.
• Protégez les majuscules dans les acronymes, les formules chimiques et les noms propres avec des accolades, par exemple title = {Effects of {DNA} damage}.
• Comparez les auteurs, les éditeurs, les sous-titres, les plages de pages, les numéros de fascicule, les résumés, les mots-clés, les URL et les dates de publication avec l’enregistrement source. Ces éléments peuvent être perdus ou réorganisés lors de l’importation.
• Vérifiez l’encodage des caractères lorsque les noms accentués ou les symboles s’affichent incorrectement. Les fichiers RIS peuvent utiliser UTF-8, Windows-1252 ou des caractères échappés ; une nouvelle exportation depuis la base de données source est souvent plus sûre que de deviner l’encodage.
• Vérifiez les champs DOI et URL. Un enregistrement contenant à la fois DO et UR peut produire des liens en double ou malformés.
• Compilez un petit document de test LaTeX avec le processeur BibTeX ou BibLaTeX prévu. BibTeX traditionnel et BibLaTeX utilisent des types d’entrées, des champs et des commandes de traitement différents.