Convertisseur en ligne gratuit de NBIB en XLSX

Une base de données de recherche, un flux de travail de sélection ou une archive peut nécessiter des notices bibliographiques sous forme de lignes de feuille de calcul modifiables plutôt que de texte balisé. La conversion des notices en XLSX facilite leur filtrage, leur vérification, leur partage et leur utilisation dans des logiciels compatibles avec Excel.

Qu’est-ce que le format NBIB ?

NBIB est un format bibliographique en texte brut utilisé par PubMed et d’autres exports de citations NCBI. Il stocke des champs balisés de type MEDLINE, tels que les auteurs, le titre, la revue, la date de publication, le résumé, le PMID, les identifiants associés au DOI et les termes MeSH. Les notices contiennent généralement des balises telles que PMID-, TI - et AU -.

PubMed crée un fichier NBIB via Send to → Citation manager. Les gestionnaires de références peuvent également importer ou exporter des fichiers NBIB. Le fichier contient les métadonnées de la citation ; il ne contient pas le PDF ni le texte intégral de l’article cité.

Qu’est-ce que le format XLSX ?

XLSX est le format de feuille de calcul basé sur XML utilisé par Microsoft Excel et pris en charge par LibreOffice Calc, Google Sheets et d’autres applications de feuille de calcul. Une conversion place normalement une citation par ligne et des champs tels que le PMID, le titre, la revue, l’année, le DOI, les auteurs et le résumé dans des colonnes distinctes.

XLSX prend en charge le tri, les filtres, les formules, plusieurs feuilles de calcul, la mise en forme des cellules et l’échange de données structurées. Ces fonctionnalités conviennent aux listes de sélection, à la déduplication, aux rapports bibliométriques et à la modification contrôlée des métadonnées de citation.

Comment convertir NBIB en XLSX

Avec Zotero et LibreOffice Calc

1. Installez et ouvrez Zotero, puis choisissez File → Import.
2. Sélectionnez le fichier .nbib et terminez l’importation. Vérifiez que les notices, auteurs, identifiants, dates et résumés attendus sont présents.
3. Sélectionnez les éléments importés, ouvrez le menu contextuel de l’élément et choisissez Export Items. Sélectionnez CSV comme format d’exportation et enregistrez le résultat sous le nom citations.csv.
4. Ouvrez citations.csv dans LibreOffice Calc. Dans la boîte de dialogue d’importation, sélectionnez UTF-8, vérifiez le séparateur et le qualificatif de texte, puis confirmez que l’aperçu sépare correctement les champs.
5. Choisissez File → Save As, sélectionnez Excel 2007–365 (.xlsx), puis confirmez le format.

Zotero interprète les balises NBIB et les champs répétés avant que le logiciel de feuille de calcul ne crée les colonnes. Les colonnes CSV exactes dépendent du convertisseur d’exportation et des champs présents dans les notices.

Pour un fichier de petite taille, vous pouvez également utiliser le convertisseur gratuit de 101convert.com sans installer de logiciel. Vérifiez les lignes et les colonnes obtenues avant d’utiliser le classeur pour des rapports ou l’analyse de données.

Précautions relatives à la qualité et à la compatibilité

• NBIB autorise les valeurs répétées, notamment pour les auteurs, les affiliations, les mots-clés et les vedettes-matière. Une conversion en XLSX peut les regrouper dans une seule cellule, les répartir sur plusieurs colonnes ou omettre certains champs, selon le convertisseur.
• Définissez le PMID, le DOI et les autres identifiants comme du texte lorsque la préservation exacte des caractères est importante. Le formatage numérique peut supprimer les zéros en tête ou modifier les longues valeurs d’identifiants.
• Utilisez UTF-8 lors de l’ouverture du fichier CSV intermédiaire afin de préserver les noms accentués, les titres dans d’autres langues et les autres caractères spéciaux.
• Les résumés et les notes peuvent contenir des retours à la ligne, des tabulations ou de longs textes. Vérifiez plusieurs lignes converties et activez le renvoi à la ligne si nécessaire. Les applications de feuille de calcul imposent également des limites de taille des cellules : les champs exceptionnellement longs peuvent donc être tronqués ou rejetés.
• Vérifiez les notices en double, le formatage des auteurs, les dates et les colonnes d’identifiants après l’exportation. XLSX conserve le tableau converti, mais pas toutes les balises NBIB, les règles de continuation ou les relations avec le gestionnaire de références.